保護土壤、樹木和咖啡樹的咖啡農場為農民和當地野生動物提供了許多好處。
傳統上，咖啡是在陰涼處種植的。
近幾十年來，咖啡農業的廣泛集約化已經消滅了大片候鳥和其他野生動物依賴生存的熱帶樹木。史密森尼候鳥中心的研究人員致力於了解土地管理（特別是咖啡等作物的種植）對當地動植物的影響。經過數十年的研究，科學家們清楚地了解了用本地遮蔭樹種植咖啡對鳥類和農民本身有何好處。
了解遮蔭種植的咖啡如何為鳥類和農民帶來好處：
樹冠
對於農民：
樹木覆蓋網絡可以保護咖啡樹免受極端溫度和降雨的影響，減少侵蝕並保持土壤水分
對於鳥類：
不同高度和品種的樹木為越冬候鳥和熱帶野生動物創造棲息地和庇護所
提供的資源
對於農民：
果樹和木材為小農提供額外收入來源
對於鳥類：
果樹和花蜜是包括鳥類在內的許多動物物種的重要食物來源
除害蟲
對於農民：
本土樹種吸引鳥類和其他生物體，有助於控制咖啡蟲害，減少農民對有害且昂貴的農藥的依賴
對於鳥類：
許多候鳥吃大量昆蟲。這抑制了咖啡害蟲的數量，幫助鳥類度過冬天並為遷徙補充能量。
落葉層
對於農民：
分解植物物質可以豐富農作物，減少除草的需要，並有助於維持更健康的土壤微生物組
對於鳥類：
分解的植物材料為昆蟲和其他土壤生物提供了藏身之處，幫助當地植物茁壯成長